mod_fcgid read data timeout in 40 seconds

В логе .error.log ошибка mod_fcgid read data timeout

тогда:
в CentOS /etc/httpd/conf.d/fcgid.conf
в Debian/Ubuntu /etc/apache2/mods-available/fcgid.conf
отредактируйте (если нету, то добавьте) строку:
IPCCommTimeout 300
, где вместо 300 — нужно подставить подходящее время ожидания. Слишком большое ставить не нужно.

Затем:
#service httpd restart